Shio Ogura es un estudiante de secundaria japonés, quien está de visita en Taiwan en un viaje de la escuela cuando de repente es atacado por monstruos. Los agentes conocidos como "E-Gene Holders" de la agencia gubernamental DOGOO estos cuentan con armas infundidas con los espíritus de personajes históricos. Shio es revelada como una E-Gene, cuando el alma de Oda Nobunaga se despierta después de que ella trata de rescatar a un amigo.